総務課
総務課
- 水産林務部の行政の企画及び総合調整に関すること。
- 水産及び森林土木工事の管理に関すること。
- 水産業・漁村の振興施策及び森林づくりを進めるための企画及び総合調整に関すること。
- 水産業及び林業の統計に関すること。
- 水産林務部の試験研究等の総合調整に関すること（他課の主管に属するものを除く。）。
水産局
水産経営課
- 水産業協同組合その他の水産業関係団体に関すること（他部課の主管に属するものを除く。）。
- 水産金融に関すること。
- 漁船保険及び漁業共済に関すること。
- 漁業経営の改善に関すること。
- 漁業者の研修及び就業に関すること。
- 漁業の担い手確保に関すること。
- 漁船海難防止に関すること。
- 漁村の活性化に関すること。
- 漁業研修所に関すること。
漁港漁場課
- 漁港漁村に関すること（他部の主管に属するものを除く。）。
- 海岸に関すること（他部の主管に属するものを除く。）。
- 沿岸漁場の整備開発に関すること。
- 沿岸水産資源開発区域に関すること。
漁業管理課
- 水産資源の管理に関すること。
- 海区漁業調整委員会との連絡に関すること。
- 内水面漁場管理委員会との連絡に関すること。
- 漁業権に関すること。
- 漁業の許可及び操業の調整その他の漁業の調整に関すること。
- 漁船に関すること。
- 水産資源の保護に関すること。
- 内水面漁業の振興に関すること。
- 遊漁船業の適正化等に関すること。
- 漁業の取締り並びに漁業取締船の維持及び運航に関すること。
- 国際漁業関連対策の企画及び総合調整に関すること。
- 外国との漁業協定及び漁業協力等に関すること。
林務局
林業木材課
- 林業の振興に関すること。
- 木材産業の振興に関すること。
- 林産物の生産及び加工に関すること。
- 林産物の需給及び流通に関すること。
- 林業・木材産業の経営改善に関すること。
- 林業従事者の担い手対策に関すること。
- 森林組合に関すること（他部の主管に属するものを除く。）。
- 林産に係る試験研究等の調整に関すること。
- 北の森づくり専門学院に関すること。
森林計画課
- 森林計画に関すること。
- 森林山村対策及び調整等に関すること（他課の主管に属するものを除く。）。
- 林業の経営指導に関すること。
- 民有林の土地利用調整に関すること。
森林整備課
- 森林整備の企画調整に関すること。
- 造林の推進及び指導に関すること。
- 森林の保護・種苗・保険に関すること。
- 路網の整備に関すること。
- 林業に係る試験研究等の調整に関すること。
治山課
- 治山に関すること。
- 防災林に関すること。
- 保安林及び保安施設地区に関すること。
- 森林に係る開発行為の規制に関すること。
- 宅地造成及び特定盛土等に関すること（林地に関するものに限る。）。
森林海洋環境局
森林海洋環境課
- 水産業に係る環境保全に関すること。
- 海洋環境変動対策に関すること。
- 木育を通じた協働の森林づくりに関すること。
- 森林吸収源対策に関すること。
- 林業の普及指導等に係る企画・調整に関すること。
道有林課
- 道有林野事業の総合調整に関すること。
- 道有林野の整備管理に係る計画に関すること。
- 道有林野の産物の売払いに関すること。
- 道有林野の造林に関すること。
- 道有林野の路網及び治山に関すること。
- 道有林野の施業試験に関すること。
成長産業課
- 栽培漁業に関すること。
- 水産業及び林業の成長産業化に関すること。
- 漁業生産構造の改革に関すること。
- 沿岸漁業の振興に関すること。
- 水産に係る試験研究等の調整に関すること。
- 水産物の衛生管理に関すること（他部の主管に属するものを除く。）。
- 水産食品産業の振興に関すること（他部の主管に属するものを除く。）。
- 漁業技術の改良普及に関すること。
- 林業の普及指導に関すること。
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